国家食品质量监督检验中心是国家质量监督检验检疫总局授权并经中国实验室国家认可委员会认可的国内从事食品产品质量监督检验、仲裁的最高权威机构。原国家食品质量监督检验中心胡国栋主任、蔡心荛教授退休后长年在燕京担任技术顾问，多年来在分析技术领域，特别是为色谱技术的方法开发与应用做出了极大的贡献，使得燕京色谱技术始终保持在中国啤酒行业的最高水平。近年来，合作的项目还包括十二五科技部项目“食品加工过程典型微生物污染在线监测与控制技术研究”；“燕京啤酒全国范围市场啤酒质量抽检与调研”。

江南大学是全国“211工程”重点建设高校之一，其生物工程、食品科学和工业设计等学科领域享誉业界。2003年，燕京与江南大学签订了副董事长单位产学研合作框架协议，在职培养工程硕士研究生与啤酒酿造技术合作。